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SGC Experimental Information Sheet |
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The data presented in this document represent preliminary experimental observations
for a de-prioritized SGC target.
We provide this information as a general service to the research community at large,
with the caveat that the data may not have been subjected to rigorous review.
Queries regarding this document or access to reagents may be addressed to
alex.hodgson@utoronto.ca
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| Target ID |
PFL2510w |
| Description |
Chitinase |
Expression constructs: |
| Construct #1 |
| Construct DNA sequence |
ATGAATTTTACTGTGAAATATTCATTTTTAGTTATTTGTTTATTATGCTGTTTATTAAGCACTTATGTAAGTGTCATTGA
GGGACATCGAGCACGACCAGGTGAATCAAGAAAAAACCCGAGAGAAATTATAAAAACATTTAAAGAGAGTGGGAAAGGAA
TTATTCAAGGTTATTATCCATCATGGGTTTCTTATAATCATAACTTGAAAGATTTAAATCCTAATTTAAATGTTGTACAT
ATGTCTTTTGCTAAGATGGATTTATCCTATGACAGTATAGAGAGTATTGTTGGTTCTCCTTTACTTTTCAAGTCATTAAT
AGGTTTAGAATATATAGGGTTAAACGAATATTTTAATGATGCCATGAATTTAAGAAAAGCTCGTCCAGATATTATTATGC
TTTTATCTCTTGGAGGAGAAACATATCATCCAAGTTCATTTGATTCTGCTTTAAATGCTGTTGAGAAAATTGCAAATTTA
GTTGATGAATTAGGATTTGATGGAATCGATGTTGATTATGAGCCTAATGGATCTTTTGATGGTTTGAACGATAAAGAGAA
AGCTGATTTTTTCGTACAATATGTAACAAAATTGAGGGAATATATGTGTGATGATAAATTAATTTCTATATCTCAATCAT
CTAACGGAGCTTTAAGTTGTATAGGTTTTAATGATCCTAAGAAAATATGTATGGATGATGAAGCACCATATAATTCAAAA
TATTTCAATAAACCTGATGTAAAAAAGGAGCTATTAAGAGCAGCGCAAATGGCTTCAGCTGGAGGAGCAATATATTTAAT
GAATAATTTAAAGGATATGATTGATATGGTGTTTGTACAAACCTTTAATTATACAAATTCTACAGATTCAACAGTTATGA
AAGAATTATATGATTCTTATGCTTATTATGGAAAAAAATATGATTATGTTATTATAATGGGATTTACATTAATGTTTCCT
TCAACCCCTTTTAATCCGAATGATAAAATGCTTGTAAAATCCATTGGTGATTTTGTAAAGACTGAAAATAAATTAAATAA
AAGAGCAGACGGGTTTGGATTATGGTCTTTATCTTCTGATAATGCTGCACATAATGAACAATTAGCAATTGAATATTTCG
TAGAATCTTTACATTAA
|
| Construct AA sequence |
MNFTVKYSFLVICLLCCLLSTYVSVIEGHRARPGESRKNPREIIKTFKESGKGIIQGYYPSWVSYNHNLKDLNPNLNVVH
MSFAKMDLSYDSIESIVGSPLLFKSLIGLEYIGLNEYFNDAMNLRKARPDIIMLLSLGGETYHPSSFDSALNAVEKIANL
VDELGFDGIDVDYEPNGSFDGLNDKEKADFFVQYVTKLREYMCDDKLISISQSSNGALSCIGFNDPKKICMDDEAPYNSK
YFNKPDVKKELLRAAQMASAGGAIYLMNNLKDMIDMVFVQTFNYTNSTDSTVMKELYDSYAYYGKKYDYVIIMGFTLMFP
STPFNPNDKMLVKSIGDFVKTENKLNKRADGFGLWSLSSDNAAHNEQLAIEYFVESLH
|
| Vector |
p28a-thrombin-lic |
| Construct #2 |
| Construct DNA sequence |
AGTGGGAAAGGAATTATTCAAGGTTATTATCCATCATGGGTTTCTTATAATCATAACTTGAAAGATTTAAATCCTAATTT
AAATGTTGTACATATGTCTTTTGCTAAGATGGATTTATCCTATGACAGTATAGAGAGTATTGTTGGTTCTCCTTTACTTT
TCAAGTCATTAATAGGTTTAGAATATATAGGGTTAAACGAATATTTTAATGATGCCATGAATTTAAGAAAAGCTCGTCCA
GATATTATTATGCTTTTATCTCTTGGAGGAGAAACATATCATCCAAGTTCATTTGATTCTGCTTTAAATGCTGTTGAGAA
AATTGCAAATTTAGTTGATGAATTAGGATTTGATGGAATCGATGTTGATTATGAGCCTAATGGATCTTTTGATGGTTTGA
ACGATAAAGAGAAAGCTGATTTTTTCGTACAATATGTAACAAAATTGAGGGAATATATGTGTGATGATAAATTAATTTCT
ATATCTCAATCATCTAACGGAGCTTTAAGTTGTATAGGTTTTAATGATCCTAAGAAAATATGTATGGATGATGAAGCACC
ATATAATTCAAAATATTTCAATAAACCTGATGTAAAAAAGGAGCTATTAAGAGCAGCGCAAATGGCTTCAGCTGGAGGAG
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TCAACAGTTATGAAAGAATTATATGATTCTTATGCTTATTATGGAAAAAAATATGATTATGTTATTATAATGGGATTTAC
ATTAATGTTTCCTTCAACCCCTTTTAATCCGAATGATAAAATGCTTGTAAAATCCATTGGTGATTTTGTAAAGACTGAAA
ATAAATTAAATAAAAGAGCAGACGGGTTTGGATTATGGTCTTTATCTTCTGATAATGCTGCACATAATGAACAATTAGCA
ATTGAATATTTCGTAGAATCTTTACAT
|
| Construct AA sequence |
SGKGIIQGYYPSWVSYNHNLKDLNPNLNVVHMSFAKMDLSYDSIESIVGSPLLFKSLIGLEYIGLNEYFNDAMNLRKARP
DIIMLLSLGGETYHPSSFDSALNAVEKIANLVDELGFDGIDVDYEPNGSFDGLNDKEKADFFVQYVTKLREYMCDDKLIS
ISQSSNGALSCIGFNDPKKICMDDEAPYNSKYFNKPDVKKELLRAAQMASAGGAIYLMNNLKDMIDMVFVQTFNYTNSTD
STVMKELYDSYAYYGKKYDYVIIMGFTLMFPSTPFNPNDKMLVKSIGDFVKTENKLNKRADGFGLWSLSSDNAAHNEQLA
IEYFVESLH
|
| Vector |
p28a-thrombin-lic |
| Construct #3 |
| Construct DNA sequence |
AAAACATTTAAAGAGAGTGGGAAAGGAATTATTCAAGGTTATTATCCATCATGGGTTTCTTATAATCATAACTTGAAAGA
TTTAAATCCTAATTTAAATGTTGTACATATGTCTTTTGCTAAGATGGATTTATCCTATGACAGTATAGAGAGTATTGTTG
GTTCTCCTTTACTTTTCAAGTCATTAATAGGTTTAGAATATATAGGGTTAAACGAATATTTTAATGATGCCATGAATTTA
AGAAAAGCTCGTCCAGATATTATTATGCTTTTATCTCTTGGAGGAGAAACATATCATCCAAGTTCATTTGATTCTGCTTT
AAATGCTGTTGAGAAAATTGCAAATTTAGTTGATGAATTAGGATTTGATGGAATCGATGTTGATTATGAGCCTAATGGAT
CTTTTGATGGTTTGAACGATAAAGAGAAAGCTGATTTTTTCGTACAATATGTAACAAAATTGAGGGAATATATGTGTGAT
GATAAATTAATTTCTATATCTCAATCATCTAACGGAGCTTTAAGTTGTATAGGTTTTAATGATCCTAAGAAAATATGTAT
GGATGATGAAGCACCATATAATTCAAAATATTTCAATAAACCTGATGTAAAAAAGGAGCTATTAAGAGCAGCGCAAATGG
CTTCAGCTGGAGGAGCAATATATTTAATGAATAATTTAAAGGATATGATTGATATGGTGTTTGTACAAACCTTTAATTAT
ACAAATTCTACAGATTCAACAGTTATGAAAGAATTATATGATTCTTATGCTTATTATGGAAAAAAATATGATTATGTTAT
TATAATGGGATTTACATTAATGTTTCCTTCAACCCCTTTTAATCCGAATGATAAAATGCTTGTAAAATCCATTGGTGATT
TTGTAAAGACTGAAAATAAATTAAATAAAAGAGCAGACGGGTTTGGATTATGGTCTTTATCTTCTGATAATGCTGCACAT
AATGAACAATTAGCAATTGAATATTTCGTAGAATCTTTACAT
|
| Construct AA sequence |
KTFKESGKGIIQGYYPSWVSYNHNLKDLNPNLNVVHMSFAKMDLSYDSIESIVGSPLLFKSLIGLEYIGLNEYFNDAMNL
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DKLISISQSSNGALSCIGFNDPKKICMDDEAPYNSKYFNKPDVKKELLRAAQMASAGGAIYLMNNLKDMIDMVFVQTFNY
TNSTDSTVMKELYDSYAYYGKKYDYVIIMGFTLMFPSTPFNPNDKMLVKSIGDFVKTENKLNKRADGFGLWSLSSDNAAH
NEQLAIEYFVESLH
|
| Vector |
p28a-thrombin-lic |
| Construct #4 |
| Construct DNA sequence |
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ACATCGAGCACGACCAGGTGAATCAAGAAAAAACCCGAGAGAAATTATAAAAACATTTAAAGAGAGTGGGAAAGGAATTA
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TCTTTTGCTAAGATGGATTTATCCTATGACAGTATAGAGAGTATTGTTGGTTCTCCTTTACTTTTCAAGTCATTAATAGG
TTTAGAATATATAGGGTTAAACGAATATTTTAATGATGCCATGAATTTAAGAAAAGCTCGTCCAGATATTATTATGCTTT
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TGATTTTTTCGTACAATATGTAACAAAATTGAGGGAATATATGTGTGATGATAAATTAATTTCTATATCTCAATCATCTA
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AATTATATGATTCTTATGCTTATTATGGAAAAAAATATGATTATGTTATTATAATGGGATTTACATTAATGTTTCCTTCA
ACCCCTTTTAATCCGAATGATAAAATGCTTGTAAAATCCATTGGTGATTTTGTAAAGACTGAAAATAAATTAAATAAAAG
AGCAGACGGGTTTGGATTATGGTCTTTATCTTCTGATAATGCTGCACATAATGAACAATTAGCAATTGAATATTTCGTAG
AATCTTTACAT
|
| Construct AA sequence |
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| Vector |
p28a-thrombin-lic |
| Construct #5 |
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STVMKELYDSYAYYGKKYDYVIIMGFTLMFPSTPFNPNDKMLVKSIGDFVKTENKLNKRADGFGLWSLSSDNAAHNEQLA
IEYFVESLH
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| Vector |
p28a-thrombin-lic |
| Construct #6 |
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NEQLAIEYFVESLH
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AAGAATTATATGATTCTTATGCTTATTATGGAAAAAAATATGATTATGTTATTATAATGGGATTTACATTAATGTTTCCT
TCAACCCCTTTTAATCCGAATGATAAAATGCTTGTAAAATCCATTGGTGATTTTGTAAAGACTGAAAATAAATTAAATAA
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MNFTVKYSFLVICLLCCLLSTYVSVIEGHRARPGESRKNPREIIKTFKESGKGIIQGYYPSWVSYNHNLKDLNPNLNVVH
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| Vector |
p28a-thrombin-lic |